生物濾池除臭的工作原理主要基于微生物的代謝作用，通過三個關鍵階段實現惡臭物質的轉化與去除，具體如下：

1、氣液擴散階段
臭氣中的污染物（如硫化氫、氨氣等）通過濕潤的填料層時，由氣相轉移到液相。填料表面的水分形成液膜，為污染物的溶解和擴散提供介質，使污染物從氣態轉變為液態，便于后續微生物作用。

2、液固擴散階段
液相中的污染物進一步向微生物膜表面擴散。微生物細胞具有較大的比表面積和吸附能力，能夠將污染物吸附并吸收進入細胞內部。這一過程依賴于微生物細胞表面的特性和污染物的化學性質，確保污染物與微生物充分接觸。

3、生物降解階段
吸附進入微生物細胞的污染物，在微生物的代謝作用下被分解。不同類型的微生物針對特定污染物發揮降解作用，例如：

含硫污染物（如硫化氫）被轉化為單質硫、硫酸鹽等無害物質；

含氮污染物（如氨氣）被轉化為硝酸鹽、亞硝酸鹽等；

其他有機污染物（如醇、醛等）被分解為二氧化碳和水。